Il restauro e la manutenzione dei reperti sono tra le principali attività del Museo che a tale fine dispone di un proprio laboratorio di restauro. Tutti i reperti esposti, incluso quelli frutto di donazioni, sono stati pazientemente ed accuratamente restaurati seguendo nella maggior parte dei casi un metodo conservativo. In alcuni casi invece, a causa di condizioni iniziali particolarmente degradate, si è proceduto al restauro totale, nel rigoroso rispetto delle tecniche realizzative dell’epoca ed impiegando materiali originali. Interventi mirati di costruzione sono stati adottati solo per le parti mancanti e non più disponibili in originale; per tali realizzazioni sono impiegate sia tecniche tradizionali sia tecniche di reverse engineering con moderni software CAD/CAM e processi di stampa 3D.